Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM54Q969K7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms