Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD1Q969G9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD1Q969G9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms