Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms