Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3AQ92664 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3AQ92664 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3AQ92664 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3AQ92664 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3AQ92664 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3AQ92664 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms