Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH3Q8TBE1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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