Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms