Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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