Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C17orf47Q8NEP4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms