Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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