Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HJURPQ8NCD3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms