Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C10orf53Q8N6V4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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