Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC16A9Q7RTY1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC16A9Q7RTY1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms