Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC29A4Q7RTT9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms