Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHFQ7M4L6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHFQ7M4L6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms