Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms