Protein–RNA interactions for Protein: Q6W2J9

BCOR, BCL-6 corepressor, humanhuman

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCORQ6W2J9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BCORQ6W2J9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCORQ6W2J9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms