Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms