Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms