Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms