Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEXMIFQ5QGS0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEXMIFQ5QGS0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEXMIFQ5QGS0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms