Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSD17B12Q53GQ0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms