Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms