Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms