Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCGF3Q3KNV8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms