Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P3H1Q32P28 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms