Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSNAXIP1Q2TAA8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms