Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC27Q2M243 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms