Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MSMPQ1L6U9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms