Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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RTL8BQ17RB0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RTL8BQ17RB0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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