Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PFKFB3Q16875 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms