Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6V1FQ16864 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATP6V1FQ16864 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms