Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UPP1Q16831 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms