Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms