Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RPE65Q16518 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPE65Q16518 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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