Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA6Q16445 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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