Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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