Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms