Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEBPEQ15744 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms