Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms