Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYCP1Q15431 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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