Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRKQ15262 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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