Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD11Q14690 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms