Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF1Q14162 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF1Q14162 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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