Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK13Q14004 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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