Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA3CQ13748 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms