Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNA1SQ13698 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1SQ13698 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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