Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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