Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL1Q13616 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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