Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCIRG1Q13488 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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