Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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